2016年，南科大计划在湖北、湖南等22个省（区、市）招生，安排在提前批次的自主招生环节录取。从2011年首届教改实验班招生开始，南科大在鄂的招生计划处于连年上涨状态，从2011年的2人上涨至2015年的60人。南科大湖北招生组负责人说，湖北生源质量优秀，且乐于报考南科大，这是在鄂招生计划连年上涨的主要因素。2016年，南科大在鄂招生预计与2015年持平，在60人左右，且会根据报考情况调整实际录取人数。